Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRRM3A6NNA2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms