Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GOLGA6L4A6NEF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms