Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms