Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC162PA2VCL2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms