Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCAF1Q9Y4C2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms