Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms