Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms