Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH3Q9UHC1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms