Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM5BQ9UGL1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms