Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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