Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms