Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms