Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms