Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
XCL2Q9UBD3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms