Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms