Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC180Q9P1Z9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms