Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLN6Q9NWW5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN6Q9NWW5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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