Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A1Q9NWF4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms