Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK-5Q9HDB9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms