Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms