Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM2Q9C040 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM2Q9C040 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM2Q9C040 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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