Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms