Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIFKQ9BYG3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms