Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms