Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCMBPQ9BTE3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms