Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms