Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms