Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM227BQ96M60 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM227BQ96M60 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms