Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms