Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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