Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF496Q96IT1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms