Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms