Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms