Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOPBP1Q92547 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms