Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms