Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms