Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GCSAMQ8N6F7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms