Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms