Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms