Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC117Q8IWD4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms