Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBRM1Q86U86 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms