Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms