Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC141Q6ZP82 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms