Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms