Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGSNQ5TDP6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms