Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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COL5A1-AS1Q5SY13 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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COL5A1-AS1Q5SY13 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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COL5A1-AS1Q5SY13 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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