Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms