Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms