Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms