Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms